Rafael Gomes escreveu um post ensinando como usar o Zabbix para monitorar o MySQL.
http://techfree.com.br/wordpress/2011/03/30/monitorando-o-mysql-com-o-zabbix/
Ele escreveu outros post interessantes sobre Zabbix que podem ser conferidos em:
Comunidade brasileira de usuários(as) do Zabbix